Diagnostyka molekularna DNA w hodowli zwierząt
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | H.HOK.DIMO9.SI.HZOHX |
Kod Erasmus / ISCED: | (brak danych) / (brak danych) |
Nazwa przedmiotu: | Diagnostyka molekularna DNA w hodowli zwierząt |
Jednostka: | Katedra Biotechnologii Zwierząt |
Grupy: | |
Punkty ECTS i inne: |
(brak)
|
Język prowadzenia: | polski |
Skrócony opis: |
Tematyka wykładów i ćwiczeń obejmuje wybrane zagadnienia związane z diagnostyką molekularną DNA. Wykłada rolę genu i genomu jako źródła informacji dla celów diagnostycznych oraz zjawisko polimorfizmu DNA. Student poznaje metody izolacji DNA, samodzielnie izoluje zwierzęce DNA genomowe z krwi, ocenia jakość i ilość wyizolowanego materiału. Zaznajamia się z metodami detekcji mutacji na poziomie DNA. W trakcie wykładów i ćwiczeń analizowane jest występowanie markerów molekularnych (genów głównych i kandydujących) wykorzystywanych w selekcji zwierzą gospodarskich, poznawane są metody wykrywania mutacji z zastosowaniem: łańcuchowej reakcji polimerazy (PCR) oraz polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP) czy metody SSCP. Praktycznie przeprowadzana jest amplifikacja fragmentów wybranych genów i rozpoznawanie genotypów zwierząt m.in. nosicieli chorób genetycznych. |
Pełny opis: |
Wykłady: Termin - diagnostyka molekularna DNA/historia i dzień dzisiejszy, genom jako źródło informacji dla celów diagnostycznych. Mutacja - źródło zmienności populacji. Identyfikacja mutacji wybranych genów warunkujących ważne cechy produkcyjne i choroby genetyczne zwierząt. Loci cech ilościowych (QTLs) użytkowości mlecznej i mięsnej bydła i trzody chlewnej. Polimorfizm sekwencji kodujących i regulacyjnych i ich wpływ na użytkowość mleczną i mięsną bydła,świń i owiec. Polimorfizm i ekspresja wybranych genów z nadrodziny TGF-beta oraz ich znaczenie w regulacji wzrostu mięśni oraz parametrów użytkowości rozpłodowej u świń, bydła i owiec. Gen Callipyge - imprinting genetyczny Encefalopatie gąbczaste zwierząt, znaczenie polimorfizmu w genie białka prionowego u owiec – programy hodowlane. Diagnostyka molekularna DNA w mikrobiologii i w weterynarii. Ćwiczenia: Zasady pracy w laboratorium diagnostycznym DNA, przepisy bhp, pobieranie materiału biologicznego, Izolacja DNA genomowego z krwi, zasady przechowywania i przesyłania wyizolowanego DNA Ocena ilościowa i jakościowa wyizolowanego DNA Elektroforeza DNA w żelu agarozowym. Omówienie zasady łańcuchowej reakcji polimerazy – PCR. Przeprowadzenie amplifikacji fragmentu wybranych genów. Ocena produktu PCR na żelu agarozowym Enzymy restrykcyjne i ich wykorzystanie. Omówienie metody PCR- RFLP i praktyczne przeprowadzenie reakcji RFLP dla przykładowego fragmentu genu. Elektroforeza fragmentów restrykcyjnych DNA w żelu agarozowym. Obliczanie frekwencji występowania alleli i genotypów analizowanych loci populacji badanej. Analiza bioinformatyczna odcinka genu amplifikowanego w trakcie ćwiczeń, porównanie do sekwencji nukleotydowej w banku genów Baza NCBI. Polimorfizm mikrosatelitarny, prezentacja rozdziału w żelu poliakrylamidowym, srebrzenie i analiza uzyskanych wyników. Przesiewowe metody badania mutacji w populacji, praktyczne przeprowadzenie metody SSCP. Ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy DNA, barwniki i sondy, zalety i wady reakcji. |
Literatura: |
Genomika bydła i świni. Pod redakcją L. Zwierzchowskiego i M. Świtońskiego, Wyd. UP Poznań 2009. Biotechnologia zwierząt. Pod redakcją L. Zwierzchowskiego. PWN 1997. Genomy. T.A. Brown. PWN 2012 |
Efekty uczenia się: |
WIEDZA - absolwent zna i rozumie: - metody i techniki oraz analizy instrumentalne wykorzystywane w diagnostyce genetycznej zwierząt - zagadnienia z zakresu diagnostyki molekularnej zwierząt gospodarskich. polimorfizmu DNA w genomach zwierząt gospodarskich. Charakteryzuje rodzaje polimorfizmu DNA w kontekście wykorzystania jako źródła markerów molekularnych. - zagadnienia z zakresu wykorzystania technik biotechnologicznych w doskonaleniu populacji zwierząt gospodarskich. UMIEJĘTNOŚCI - absolwent potrafi: - samodzielnie przeprowadzać eksperymenty, interpretować ich wyniki, wyizolować kwasy nukleinowe ze zwierzęcego materiału biologicznego, ocenić jego jakość i przydatność do analiz molekularnych. - analizować i twórczo wykorzystać informacje ze źródeł dotyczących diagnostyki molekularnej zwierząt - dobrać techniki diagnostyki genetycznej w poszukiwaniu zmienności u zwierząt KOMPETENCJE SPOŁECZNE - absolwent jest gotów do: - współpracy w ramach zespołu i koordynacja jego pracy |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.