Organizmy modelowe

Wykłady:

1-2. Historia badań prowadzonych z organizmami modelowymi. Definicje. Strategia badań na organizmach modelowych. Cechy najbardziej popularnych organizmów modelowych. Nagrody Nobla przyznane za badania związane z organizmami modelowymi.Badania związane z sekwencjonowaniem genomu. Poziomy organizacji informacji biologicznej i jej ekspresji.

3-4. Modelowe wirusy - bakteriofagi, TMV.

5-6. Modelowe bakterie właściwe - Escherichia coli, Bacillus subtilis, Caulobacter crescentus, Aliivibrio fischeri, Mycoplasma. Minimal Genome Project.

7-8. Liczebność i różnorodność gatunkowa eukariontów - najnowsze wyniki badań. Grzyby modelowe - Saccharomyces cerevisiae (Saccharomyces Genome Databas), Podospora anserina, Eremothecium gossypii, Aspergillus nidulans.

9-10. Protisty zwierzęce (pierwotniaki i śluzowce), roślinne (eugleniny, brunatnice, bruzdnice, okrzemki), grzybopodobne - budowa. Charakterystyka wybranych protistów modelowych. Symbioza jako główny motor zmian ewolucyjnych. Teoria Gai.Taksonomia zwierząt. Obowiązujące nazewnictwo biologiczne - wytyczne. Caenorhabditis elegans. Konektomika - jak daleko jesteśmy. Drosophila melanogaster. Przyszłość organizmów modelowych.

11-12. Specyfika roślinmodelowych; dlaczego potrzebne są rośliny modelowe.

13-14. Charakterystyka genomu, najważniejszych cech i wykorzystania roślin modelowych: Arabidopsis thaliana, Medicago truncatula, Lotus japonicus, Populus, Brachypodium distachyon.

Ćwiczenia:

1-2. Obserwacje mikroskopowe wybranych mikroorganizmów modelowych.

3-4. Zapoznanie się z metodami hodowli modelowych glonów Chlorella w laboratorium IFR PAN.

5-6. Grzyby modelowe w laboratorium - prace hodowlane.

7-8. Drosophila melanogaster - budowa, metody hodowli, mutacje.

9-10. Rośliny uprawne jako model; ryż, jęczmień, pszenica, kukurydza. Zastosowanie wiedzy o genomie roślin uprawnych w praktyce.

11-12. Fenotypowanie cech morfologicznych i fizjologicznych na przykładzie mutantów jęczmienia i A.thaliana.

13-15. Wizyta w zwierzętarni i hodowli Danio rerio.

Struktura aktywności studenta:

Zajęcia realizowane z bezpośrednim udziałem prowadzącego 42 godz., ECTS 1,4

w tym:

wykłady 15 godz.

ćwiczenia i seminaria 15 godz.

konsultacje 10 godz.

udział w badaniach 0 godz.

obowiązkowe praktyki i staże 0 godz.

udział w egzaminie i zaliczeniu 2 godz.

e-learning 0 godz.

praca własna (1,6 ECTS) 48 godz.

Po zakończeniu kursu student:

Wiedza:

- ma rozszerzoną wiedzę z zakresu budowy, funkcji i znaczenia organizmów modelowych

- ma pogłębioną wiedzę na temat funkcjonowania organizmów modelowych na różnych poziomach organizacji i możliwości ich wykorzystania w badaniach podstawowych i biotechnologii

Umiejętności:

- posiada umiejętność korzystania z literatury naukowej oraz przetwarzania i interpretowania danych z różnorodnych źródeł informacji

- posiada poszerzoną umiejętność przygotowywania i prezentowania pracy pisemnej na wskazany temat w oparciu o dostępne źródła w tym w języku angielskim

Kompetencje społeczne:

- ma świadomość poziomu wiedzy i docenia potrzebę łączenia wiedzy interdyscyplinarnej

- postępuje etycznie przy prowadzeniu eksperymentów oraz przy zbieraniu i opisywaniu danych