Hodowla molekularna
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | O.GHN.HMOL1.SM.OOGBY |
Kod Erasmus / ISCED: | (brak danych) / (brak danych) |
Nazwa przedmiotu: | Hodowla molekularna |
Jednostka: | Zakład Genetyki, Hodowli Roślin i Nasiennictwa |
Grupy: |
Bioinżynieria, 1 sem. stacj. mag. obowiązkowe |
Punkty ECTS i inne: |
(brak)
|
Język prowadzenia: | polski |
Skrócony opis: |
W ramach przedmiotu scharakteryzowane zostaną metody laboratoryjne wykorzystywane w celu identyfikacji markerów molekularnych oraz podstawowe systemy identyfikacji markerów dominujących i kodominujących. Przedstawione zostaną zasady konstruowania genetycznych map sprzężeń, mapowania asocjacyjnego, analizy loci cech ilościowych (QTL), a także możliwości wykorzystania markerów molekularnych w procesie doskonalenia roślin uprawnych, w tym hodowla wspomagana markerami, krzyżowanie wsteczne wspomagane markerami, selekcja genomowa, ocena pokrewieństwa, czystości nasion odmian F1, itp. |
Pełny opis: |
Treści kształcenia Zmienność genetyczna na poziomie molekularnym, źródła zmienności Podstawowe metody laboratoryjne (hybrydyzacja, PCR, elektroforeza) Techniki identyfikacji arbitralnych markerów w oparciu o PCR (RAPD, AFLP) Techniki wykorzystujące sekwencje powtarzalne tandemowo (mikrosatelity) i rozproszone (ruchome elementy genetyczne) Wysokowydajne techniki genotypowania (platforma DArT, polimorfizmy pojedynczego nukleotydu – SNP) Markery rejonów scharakteryzowanych sekwencyjnie (SCAR, CAPS) Mapowanie genetyczne i mapowanie asocjacyjne, sprzężenie pomiędzy markerem i cechą, loci cech ilościowych (QTL) Hodowla wspomagana markerami (MAS), krzyżowanie wsteczne wspomagane markerami (MABC), selekcja cykliczna wspomagana markerami (MARS), selekcja genomowa (GWS) Ocena zróżnicowania genetycznego, fingerprinting, dystans genetyczny Identyfikacja markerów molekularnych sprzężonych z cechą użytkową – studia przypadków Identyfikacja markerów RAPD (założenie reakcji RAPD-PCR, elektroforeza w żelu agarozowym, wizualizacja) Identyfikacja markerów AFLP (elektroforeza w żelu poliakrylamidowym, barwienie srebrowe) Dystans genetyczny, komputerowe opracowanie i graficzna prezentacja wyników |
Literatura: |
Malepszy S. (red.) 2009. Biotechnologia roślin. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa Michalik B. (red.) 2009. Hodowla roślin z elementami genetyki i biotechnologii. Państwowe Wydawnictwo Rolnicze i Leśne, Poznań |
Efekty uczenia się: |
Opis efektów kształcenia Wiedza Wyjaśnia mechanizmy warunkujące powstanie zmienności genetycznej oraz jej znaczenie w procesie doskonalenia roślin uprawnych Opisuje założenia podstawowych metod laboratoryjnych wykorzystywanych w celu identyfikacji polimorfizmów DNA Charakteryzuje najpowszechniej używane systemy identyfikacji markerów molekularnych Porównuje metody mapowania genomu – mapowanie genetyczne i mapowanie asocjacyjne Uzasadnia znaczenie wspomagania hodowli roślin technikami molekularnymi Umiejętności Zakłada reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) Wykonuje elektroforezę produktów powielania w żelach agarozowych i poliakrylamidowych Interpretuje wyniki analiz molekularnych Przygotowuje krótkie wystąpienie ustne na temat hodowli molekularnej Kompetencje społeczne Formułuje obiektywne opinie na temat znaczenia technik molekularnych w doskonaleniu roślin uprawnych |
Metody i kryteria oceniania: |
raport z ćwiczeń esej egzamin testowy |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.