Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Plant genomics

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: O.F3.PGE.SM.OOBXY
Kod Erasmus / ISCED: (brak danych) / (brak danych)
Nazwa przedmiotu: Plant genomics
Jednostka: Katedra Biologii Roślin i Biotechnologii
Grupy:
Punkty ECTS i inne: (brak) Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS:
  • roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS;
  • tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h;
  • 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się;
  • tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS;
  • nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta.

zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia: (brak danych)
Skrócony opis:

Current state of knowledge on the structure and function of plant genomes, analytical tools (next generation sequencing, global expression profiling, in silico analyses)

Structure and function of plant genomes, Arabidopsis thaliana as a model plant genome, experimental methods of genome analysis, genome annotation, genome evolution, mobile genetic elements, comparative genomics

Pełny opis:

Definition and history of genomics, structural, functional, and comparative genomics, genetic mapping of plant genomes, whole genome sequencing – methods and perspectives, structure of plant genomes, repetitive DNA – origin and function, mechanisms of genome evolution, comparative genomics, functional genomics, methods for global transcriptome analysis

Exploration of DNA and protein sequence databases, in silico analysis of DNA sequences, sequence alignment and similarity

Literatura:

Meksem K, Kahl G (eds.), 2005. The Handbook of Plant Genome Mapping. Wiley-VCH, Weinheim.

Sensen CW (ed.), 2005. Handbook of Genome Research. Wiley-VCH, Weinheim, vol. 1 and 2.

Lankenau D-H, Volff J-N (eds.), 2009. Transposons and the Dynamic Genome. Springer, Dordrecht.

The Arabidopsis Genome Initiative, 2000. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. Nature 408: 796-815.

Metody i kryteria oceniania:

test 703

essay/report 711

Przedmiot nie jest oferowany w żadnym z aktualnych cykli dydaktycznych.
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.
kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.3.0 (2024-03-22)