Analiza instrumentalna
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | H.KFZ.ANAIN.SM.HZOBX |
Kod Erasmus / ISCED: | (brak danych) / (brak danych) |
Nazwa przedmiotu: | Analiza instrumentalna |
Jednostka: | Katedra Fizjologii i Endokrynologii Zwierząt |
Grupy: | |
Punkty ECTS i inne: |
(brak)
|
Język prowadzenia: | polski |
Skrócony opis: |
Celem nauczania jest zaznajomienie studentów kierunku Biologia z podstawowymi pojęciami oraz nowoczesnymi metodami i technikami analitycznymi stosowanymi w badaniach naukowych: technikami chromatograficznymi, spektrofotometrycznymi, metodami stosowanymi w proteomice, analizie kwasów nukleinowych, metodami służącymi do oznaczania hormonów i białek, metodami mikroskopii fluorescencyjnej. |
Pełny opis: |
Wykłady: 1. Analiza instrumentalna – definicja, metody instrumentalne, zasady pobierania, przygotowywania i przechowywania próbek biologicznych do badań laboratoryjnych. Metody ekstrakcji substancji biologicznych z tkanek zwierzęcych. Etapy procesu analitycznego. - 2 h. 2. Podział technik analitycznych. Metody optyczne i ich zastosowanie w badaniach laboratoryjnych (absorpcjometria, spektrofotometria UV/VIS, spektrofotometria w podczerwieni (IR)) - 2 h. 3. Metody chromatograficzne – typy chromatografii, chromatografia HPCL i jej zastosowanie w analizach biologicznych. - 2 h 4. Metody analityczne i urządzenia wykorzystywane w proteomice (strategie proteomiczne, przygotowanie próbek analitycznych, elektroforeza białek, analiza żeli, spektrometria masowa, zintegrowane systemy analityczne). - 2 h. 5. Metody analityczne i urządzenia wykorzystywane w genomice (elektroforeza kwasów nukleinowych, analizatory PCR, real-time-PCR, macierze molekularne). - 2 h 6. Technika ELISA i jej zastosowanie w diagnostyce laboratoryjnej i badaniach naukowych. - 2 h 7. Mikroskopia fluorescencyjna i jej wykorzystanie. - 2 h. 8. Egzamin - test wyboru - 1 h. Ćwiczenia: 1. Wprowadzenie. Pobieranie materiału do badań. Chromatografia bibułowa i kolumnowa - 5 h. 2. Pomiary promieniowania gamma, metoda radioimmunologiczna – licznik promieniowania gamma (LKB) - 5 h. 3. Pomiar promieniowania beta (płynna scyntylacja), oznaczanie proliferacji komórek z zastosowaniem radioaktywnej tymidyny – licznik promieniowania beta (Beckman) - 5 h. 4. Badanie ekspresji genów na poziomie mRNA – metoda RT-PCR i Real time PCR – aparat StepOne Plus (Applied Biosystem) - 5 h. 5. Oznaczanie stężenia hormonów techniką ELISA - 5 h. 6. Badanie apoptozy – wykorzystanie mikroskopii fluorescencyjnej - 5 h. 7. Mikroskopia odwrócona w badaniu przeżywalności linii komórkowej - 5 h Zaliczenie - na podstawie sprawozdań z poszczególnych ćwiczeń laboratoryjnych. |
Literatura: |
Zygfryd Witkiewicz, „Podstawy chromatografii”, Wyd. Naukowo-Techniczne, Warszawa, 1992. Andrzej Kozik, Maria Rąpała-Kozik, Ibeth Guevara-Lora, „Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane problemy i metody instrumentalnej biochemii analitycznej”, Instytut Biol. Mol., UJ, Kraków 2001. Agnieszka Kraj i Jerzy Silberring, „Proteomika”, Wydział Chemii UJ, 2004. A. Kraj, Anna Drabik, Jerzy Silberring, „Proteomika i metabolomika” Wyd, Uniwersytetu Warszawskiego, 2010. Genowefa Ślósarek, „Biofizyka molekularna”, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2011. |
Efekty uczenia się: |
Wiedza: 1. Student potrafi scharakteryzować podstawowe metody analityczne i instrumentalne wykorzystywane w badaniach naukowych. 2. Posiada wiedzę o zasadach pobierania, przygotowywania i przechowywania próbek biologicznych do badań laboratoryjnych, opisać metody ekstrakcji substancji biologicznych z tkanek zwierzęcych. 3. Umie scharakteryzować podstawowe metody optyczne, chromatograficzne wykorzystywane w analityce laboratoryjnej oraz metody wykorzystywane w genomice i proteomice. 4. Jest w stanie wytłumaczyć zasadę oraz określić zastosowanie metody ELISA i RIA. 5. Umie scharakteryzować technikę mikroskopii fluorescencyjnej oraz podać jej zastosowanie w badaniach naukowych. Umiejętności: W wyniku przeprowadzonych zajęć student powinien umieć: a) wykonać prosty rozdział chromatograficzny mieszaniny związków chemicznychi/lub białek przy zastosowaniu chromatografii bibułowej i/lub kolumnowej, b) przeprowadzić analizę radioummonologiczną (RIA) określonego hormonu, c) zaprojektować i wykonać test ELISA dla określonego białka lub hormonu, d) przeprowadzić test proliferacji komórek stosując radioaktywną tymidynę, e) zaprojektować i przeprowadzić analizę ekspresji mRNA danego genu przy zastosowaniu metody RT-PCR i qPCR, f) posługiwać się mikroskopem fluorescencyjnym i zastosować go w badaniach histologicznych, g) ocenić przeżywalność linii komórkowej przy zastosowaniu mikroskopii odwróconej. Kompetencje: - potrafi pracować w grupie i kierować małym zespołem. - posiada świadomość odpowiedzialności, oraz ryzyka stosowanych metod analitycznych. |
Metody i kryteria oceniania: |
Po wysłuchaniu wykładów student powinien być w stanie scharakteryzować podstawowe metody instrumentalne, określić zasady pobierania, przygotowywania i przechowywania próbek biologicznych do badań laboratoryjnych, opisać metody ekstrakcji substancji biologicznych z tkanek zwierzęcych. Powinien scharakteryzować podstawowe metody optyczne i określić ich zastosowanie w badaniach laboratoryjnych (absorpcjometria, spektrofotometria UV/VIS, spektrofotometria w podczerwieni (IR)). Student powinien umieć opisać i zdefiniować podstawowe metody chromatograficzne (w tym metodę HPLC). Powinien umieć objaśniać i wytłumaczyć zasadę metod analitycznych i urządzeń wykorzystywanych w proteomice (znać podstawowe strategie proteomiczne, metody przygotowania próbek analitycznych, elektroforezy białek, analizy żeli, zintegrowane systemy analityczne). Powinien być w stanie zdefiniować metody analityczne i urządzenia wykorzystywane w genomice (elektroforezę kwasów nukleinowych, analizatory PCR, real-time-PCR, macierze molekularne). Student powinien również znać zasadę i zastosowanie metody ELISA i RIA oraz mikroskopii fluorescencyjnej. W wyniku przeprowadzonych ćwiczeń laboratoryjnych student powinien umieć: wykonać prosty rozdział chromatograficzny mieszaniny związków chemicznychi/lub białek przy zastosowaniu chromatografii bibułowej i/lub kolumnowej, przeprowadzić analizę radioummonologiczną (RIA) określonego hormonu oraz obsługiwać licznik promieniowania gamma, zaprojektować i wykonać test ELISA dla określonego białka lub hormonu, przeprowadzić test proliferacji komórek stosując radioaktywną tymidynę oraz wykorzystując licznik promieniowania beta, zaprojektować i przeprowadzić analizę ekspresji mRNA danego genu przy zastosowaniu metody RT-PCR i qPCR, posługiwać się mikroskopem fluorescencyjnym i zastosować go w badaniach histologicznych, ocenić przeżywalność linii komórkowej przy zastosowaniu mikroskopii odwróconej. Kryteria oceny: Wykłady: test wyboru; na ocenę 5,0 - >90% poprawnych odpowiedzi na ocenę 4,5 - 81-90% poprawnych odpowiedzi na ocenę 4,0 - 71-80% poprawnych odpowiedzi na ocenę 3,5 - 61-70% poprawnych odpowiedzi na ocenę 3,0 - 55-60% poprawnych odpowiedzi na ocenę 2,0 <55% poprawnych odpowiedzi Ćwiczenia: zaliczenie sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych. |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.