Diagnostyka molekularna DNA w hodowli zwierząt
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | H.KBZ.DIAG9.SI.HZOHY |
Kod Erasmus / ISCED: | (brak danych) / (brak danych) |
Nazwa przedmiotu: | Diagnostyka molekularna DNA w hodowli zwierząt |
Jednostka: | Katedra Żywienia, Biotechnologii Zwierząt i Rybactwa |
Grupy: |
Zootechnika stacjonarne elektywy I stopień |
Punkty ECTS i inne: |
4.50
|
Język prowadzenia: | (brak danych) |
Skrócony opis: |
Przedmiot wykłada m. in. rolę genu i genomu jako źródła informacji dla celów diagnostycznych oraz zjawisko polimorfizmu DNA. Student ocenia jakość i ilość izolowanego z materiałów biologicznych gDNA. Zaznajamia się ze zjawiskiem mutacji oraz metodami detekcji mutacji na poziomie DNA. Zapoznaje się z możliwościami zastosowania metody PCR w hodowli zwierząt. Praktycznie przeprowadza amplifikację fragmentów wybranych genów i przy zastosowaniu metody RFLP rozpoznaje genotypy zwierząt i interpretuje wyniki analiz laboratoryjnych, identyfikując obecność genów o dużym efekcie. Przeprowadza analizę polimorfizmu loci mikrosatelitarnych w kontekście ustalania pokrewieństwa i badań filogenetycznych. Przedstawione są metody przesiewowego badania mutacji (SNP) w populacjach zwierzęcych m.in. PCR-SSCP, TGGE, DGGE. |
Pełny opis: |
Wykłady: Genom źródłem informacji dla celów diagnostycznych Przypomnienie pojęć biologii: przyczyny i rodzaje mutacji. Detekcja mutacji na poziomie DNA, rodzaje mutacji i skutki mutacji genowych Markery molekularne wykorzystywane w ocenie użytkowości mięsnej, mlecznej i rozpłodowej zwierząt gospodarskich Mutacje wywołujące choroby genetyczne u bydła, owiec, świń, koni Zastosowanie diagnostyki molekularnej w weterynarii Zastosowanie analizy loci mikrosatelitarnych i minisatelitarnych w określaniu pokrewieństwa zwierząt (kontroli pochodzenia, badaniach filogenetycznych) Ćwiczenia: Metody pobierania, przechowywania materiału biologicznego, izolacja DNA, zasady oceny, przechowywania i przesyłania wyizolowanego DNA Identyfikacja zmienności metodą PCR-RFLP, zastosowanie jej w identyfikacji genów o dużym efekcie. Optymalizacja reakcji PCR z wykorzystaniem gradientu temperatury przyłączania starterów, ocena specyficzności produktu, czynniki warunkujące efektywność reakcji PCR Zastosowanie metody PCR-RFLP w identyfikacji genów o dużym efekcie. Genotypowanie zwierząt metodą różnicowania alleli AD przy użyciu Real-time PCR Izolacja DNA genomowego z produktów zwierzęcych przetworzonych. Metody oczyszczania DNA, przygotowanie produktu PCR do sekwencjonowania Polimorfizm konformacyjny ssDNA –SSCP, MSSCP – możliwości zastosowania w badaniu SNP w populacjach zwierzęcych. Przygotowanie żelu natywnego poliakrylamidowego. Optymalizacja metody. Wykonanie reakcji multipleks PCR dla loci mikrosatelitarnych. Przeprowadzenie elektroforezy produktów PCR w przygotowanym żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących. Barwienie rozwiniętego żelu metodą srebrzenia. Odczyt i interpretacja wyników. |
Literatura: |
Avise J.C. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego;. 2008 Biotechnologia Zwierząt pod red. Zwierzchowskiego PWN; 1997 Genetyka zwierząt. K. Charon i M. Świtoński, PWN, 2004 Uzupełniająca: Genomy. Brown, PWN, 2009 Genomika i Genetyka zwierząt. K. Charon i M. Świtoński. PWN, 2012 |
Efekty uczenia się: |
WIEDZA - absolwent zna i rozumie: - metody i techniki oraz analizy instrumentalne wykorzystywane w diagnostyce genetycznej zwierząt - zagadnienia z zakresu diagnostyki molekularnej zwierząt gospodarskich. polimorfizmu DNA w genomach zwierząt gospodarskich. Charakteryzuje rodzaje polimorfizmu DNA w kontekście wykorzystania jako źródła markerów molekularnych. - zagadnienia z zakresu wykorzystania technik biotechnologicznych w doskonaleniu populacji zwierząt gospodarskich. UMIEJĘTNOŚCI - absolwent potrafi: - samodzielnie przeprowadzać eksperymenty, interpretować ich wyniki, wyizolować kwasy nukleinowe ze zwierzęcego materiału biologicznego, ocenić jego jakość i przydatność do analiz molekularnych. - analizować i twórczo wykorzystać informacje ze źródeł dotyczących diagnostyki molekularnej zwierząt - dobrać techniki diagnostyki genetycznej w poszukiwaniu zmienności u zwierząt KOMPETENCJE SPOŁECZNE - absolwent jest gotów do: - współpracy w ramach zespołu i koordynacja jego pracy |
Metody i kryteria oceniania: |
Wykłady - egzamin pisemny (60%) Ćwiczenia - zaliczenie pisemne (40%) |
Zajęcia w cyklu "Semestr zimowy 2020/2021" (zakończony)
Okres: | 2020-10-01 - 2021-02-24 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia laboratoryjne, 30 godzin
Wykład, 15 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Urszula Kaczor | |
Prowadzący grup: | (brak danych) | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Zaliczenie na ocenę |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.