Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie - Centralny System UwierzytelnianiaNie jesteś zalogowany | zaloguj się
katalog przedmiotów - pomoc

Markery molekularne

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: B.6s.MAR.SI.BBTSX Kod Erasmus / ISCED: (brak danych) / (brak danych)
Nazwa przedmiotu: Markery molekularne
Jednostka: Katedra Fizjologii, Hodowli Roślin i Nasiennictwa
Grupy: Biotechnologia, 6 sem. stacjonarne, obowiązkowe
Punkty ECTS i inne: 2.00
Język prowadzenia: polski
Skrócony opis:

Celem przedmiotu jest zapoznanie studentów z różnymi typami markerów molekularnych oraz praktycznym ich wykorzystaniem w różnych dziedzinach nauki, a także w praktyce klinicznej oraz medycynie sądowej. Omawiane są obszary polimorficzne DNA jądrowego, chloroplastowego i mitochondrialnego. Studenci poznają różne typy markerów molekularnych opartych o techniki hybrydyzacyjne oraz reakcję PCR. Szeroko prezentowane jest wykorzystanie markerów molekularnych w diagnostyce chorób genetycznych i nowotworowych a także farmakogenetyce. Poruszane są również problemy wykorzystanie osiągnięć w dziedzinie biologii molekularnej w medycynie sądowej i kryminalistyce. Studenci zaznajamiani są z najnowszymi metodami diagnostyki chorób roślin i zwierząt oraz wykorzystaniem markerów molekularnych w hodowli. Przedstawiane są również przykłady stosowania analiz molekularnych w badaniach pochodzenia człowieka, filogenetyce roślin i zwierząt.

Pełny opis:

Organizacja genomów ze wskazaniem sekwencji polimorficznych DNA. Transpozony, retrotranspozony, pseudogeny, retropseudogeny, relikty genowe i ich znaczenia jako markerów molekularnych.Definicja i rodzaje markerów molekularnych. Przegląd definicji podawanych przez różnych autorów. Markery oparte na technikach hybrydyzacji.Markery molekularne związane z genami: polimorfizm w obrębie intronów i eksonów, polimorfizm w obrębie rodzin genowych (polimorfizm w obrębie genów rRNA). Markery oparte na reakcji PCR.

Markery związane z niekodujacym DNA: metody badania polimorfizmu mini- i mikrosatelitarnego DNA. Polimorfizm sekwencji anonimowych: RAPD, AFLP.

Polimorfizm oraz markery cp DNA.

Polimorfizm oraz markery mtDNA.

Wykorzystanie markerów molekularnych w diagnostyce chorób genetycznych: markery wewnątrzgenowe i sprzężone z genami, których mutacje są przyczyną chorób genetycznych.

Molekularne markery nowotworowe. Geny supresorowe, onkogeny, geny mutatorowe. Diagnostyka molekularna chorób nowotworowych.

Farmakogenetyka: rodzaje markerów molekularnych oraz ich wykorzystanie w określaniu wrażliwości na określone grupy leków.

Markery molekularne stosowane w medycynie sądowej: sprawy o sporne ojcostwo, identyfikacja śladów biologicznych z miejsca przestępstwa.

Diagnostyka molekularna chorób roślin i zwierząt. Wykorzystanie markerów molekularnych w badaniach jedno- i wielogenowych cech użytkowych.

Wykorzystanie markerów molekularnych w badania populacyjnych i filogenetycznych roślin, zwierząt i człowieka.

W ramach ćwiczeń studenci poznają alternatywne metody izolacji DNA. Samodzielnie przygotowują próbki do reakcji PCR z wykorzystaniem starterów dla określonych markerów, przeprowadzają rozdziały elektroforetyczne i analizę uzyskanych wyników. Na podstawie posiadanej wiedzy o markerach molekularnych studenci planują badania naukowe i diagnostyczne, w których mogą mieć zastosowania analizy markerów molekularnych. Samodzielnie ustalają tematykę, metodykę oraz listę niezbędnego sprzętu laboratoryjnego i odczynników chemicznych.

--.

Literatura:

1. “Biologia molekularna w medycynie”, R ed. J Bal. PWN, 2002.

2. “Biotechnologia roślin”, Red. S. Malepszy, PWN 2001.

3. “Biotechnologia Zwierząt”, Red. L. Zwierzchowski, PWN, 1999.

4. “Genomy”, Red. A. T. Brown, PEN, 2001.

5. Bachmann K. 2001; Evolution and the genetic analysis of populations: 1950-2000. Taxon 50: 195-233.

6. Crawford D.J. 2000; Plant macromolecular systematics in the 50 years: one view. Taxon 49: 81-103.

7. P.S. Soltis, D.E. Soltis, J.J. Doyle. Molecular Systematics of Plants. Chapman and Hall, New York, London 1992.

--..

Efekty uczenia się:

WIEDZA - absolwent zna i rozumie:

- ma wiedzę na temat obszarów polimorficznych w DNA jądrowym, chloroplastowym i mitochondrialnym.

- zna podstawowe markery molekularne i ich wykorzystanie

UMIEJĘTNOŚCI - absolwent potrafi:

- potrafi zaplanować badania z wykorzystaniem markerów molekularnych.

- umie przeprowadzić analizę molekularna opartą na markerach molekularnych.

- ocenia przydatność markerów molekularnych w hodowli rośli i zwierząt oraz medycynie.

KOMPETENCJE SPOŁECZNE - absolwent jest gotów do:

- ma świadomość korzyści wynikających ze stosowania markerów molekularnych w badaniach filogenetycznych i populacyjnych, hodowli roślin i zwierząt, diagnostyce chorób oraz medycynie sądowej.

- potrafi pracować w zespole.

- rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie w tym dokształcania się w zakresie biotechnologii.

Metody i kryteria oceniania:

Wykłady: Test jednokrotnego wyboru połączony z pytaniami otwartymi (70%)

Ćwiczenia: Test jednokrotnego wyboru połączony z pytaniami otwartymi (30%)

na ocenę 5: student zna min. 80% treści

na ocenę 4: student zna min. 65% treści

na ocenę 3: student zna min. 50 % treści

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2017/2018" (zakończony)

Okres: 2018-02-26 - 2018-09-30
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Ćwiczenia laboratoryjne, 15 godzin więcej informacji
Wykład, 15 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Sutkowska
Prowadzący grup: Urszula Kaczor, Agnieszka Sutkowska, Małgorzata Szczęsna
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Przedmiot - Zaliczenie na ocenę
Ćwiczenia laboratoryjne - Zaliczenie na ocenę
Wykład - Zaliczenie na ocenę

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2018/2019" (zakończony)

Okres: 2019-02-25 - 2019-09-30
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Ćwiczenia laboratoryjne, 15 godzin więcej informacji
Wykład, 15 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Sutkowska
Prowadzący grup: Elżbieta Golemiec, Urszula Kaczor, Agnieszka Sutkowska, Małgorzata Szczęsna, Tomasz Warzecha
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Przedmiot - Zaliczenie na ocenę
Ćwiczenia laboratoryjne - Zaliczenie na ocenę
Wykład - Zaliczenie na ocenę

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2019/2020" (zakończony)

Okres: 2020-02-24 - 2020-09-30
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Ćwiczenia laboratoryjne, 15 godzin więcej informacji
Wykład, 15 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Sutkowska
Prowadzący grup: Urszula Kaczor, Julia Rutkowska, Agnieszka Sutkowska, Małgorzata Szczęsna, Tomasz Warzecha
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Przedmiot - Zaliczenie na ocenę
Ćwiczenia laboratoryjne - Zaliczenie na ocenę
Wykład - Zaliczenie na ocenę

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2020/2021" (jeszcze nie rozpoczęty)

Okres: 2021-02-25 - 2021-09-30
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Ćwiczenia laboratoryjne, 15 godzin więcej informacji
Wykład, 15 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Agnieszka Sutkowska
Prowadzący grup: Urszula Kaczor, Julia Rutkowska, Agnieszka Sutkowska, Małgorzata Szczęsna, Tomasz Warzecha
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Przedmiot - Zaliczenie na ocenę
Ćwiczenia laboratoryjne - Zaliczenie na ocenę
Wykład - Zaliczenie na ocenę
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie.